Les missions de rang S:
Rang :SLieu : Partout
Mission : Vous devrez constituer une équipe de trois afin de partir pendant un certain temps à l’extérieur du village. L'otokage vous donnera au préalable quelques informations complémentaires avant votre départ. Votre but sera de trouver l’emplacement exact du campement de l’organisation Akatsuki.
Obligation : éviter l’affrontement avec un membre de la Lune rouge.
Rang :SLieu : Suna
Mission : Vous devrez constituer une équipe afin d’infiltrer Suna et enlever un garde du village. Ce dernier devra être ramené à Oto en vie car il constituera une mine d’information des plus intéressantes. Il est préférable de ne pas vous faire repérer outre mesure. Le cas échéant, vous pouvez user de la force du moment que personne ne vous file à votre retour au village.
Obligation : Entretient avec l'Otokage avant de partir en mission.
Rang :SLieu : Partout
Mission : Constitution d’une équipe afin de localiser l’emplacement d’un éventuel campement de la Team Taka. Une fois cet objectif atteint, vous devrez filer pendant trois jours les membres afin de collecter un maximum d’information.
Obligation :Si vous êtes amené à combattre, il serait préférable de ramener un membre de la Team Taka en vie jusqu’au village.
Rang :SLieu : Partout.
Mission : Constitution d’une équipe afin de parcourir le monde ninja et de kidnapper plusieurs shinobis ayant des pouvoirs héréditaires intéressants. Vous devrez donc infiltrer plusieurs villages et enlever des shinobis de haut rang afin de les ramener vivant ou partiellement blessé à l'antre du Serpent. Les utilisateurs de Dojutsu sont particulièrement recherché par le chef spirituel et militaire du village.
Obligation :Ramener au moins un utilisateur du Sharingan et/ou du Byakugan.
Rang :SLieu :Konoha/Suna
Mission : Constitution de deux équipes qui partiront en direction de Konoha pour la première et Suna pour la deuxième. Ces deux équipes auront pour but de mener une première attaque coordonnée sur les deux villages afin d’affaiblir des points stratégiques. L’attaque devra être rapide et efficace, il faudra causer quelques dégâts et repartir aussitôt vers Oto.
Obligation : le but étant d’affaiblir au mieux Konoha et Suna sans prendre trop de risques, il conviendra donc de viser des cibles « économiques » et « militaires ».